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DNA wie viele Basen pro Runde

Drei Hauptformen von DNA sind doppelsträngig und durch Wechselwirkungen zwischen komplementären Basenpaaren verbunden. T Basenpaar und rechts ein G: C Basenpaar.

Basen passen in das Doppelhelixmodell, wenn Pyrimidin auf einem Strang immer mit Purin auf dem anderen gepaart ist. Dies paart eine Ketobase mit einer Aminobase, ein Purin mit einem Pyrimidin.

Diese dritte H-Bindung im G: C-Basenpaar liegt zwischen der zusätzlichen exocyclischen Aminogruppe an G und der C2-Ketogruppe an C. Die Pyrimidin-C2-Ketogruppe ist nicht an der Wasserstoffbindung im A: T-Basenpaar beteiligt. Dies sind die komplementären Basenpaare. Antiparallele a, plektonologisch gewickelte b-, c-, d-DNA-Stränge. Die beiden Stränge des Duplex sind antiparallel und plektonämisch gewickelt.

Die in einer 5'- bis 3'-Orientierung auf einem Strang angeordneten Nukleotide richten sich mit komplementären Nukleotiden in der 3'- bis 5'-Orientierung des gegenüberliegenden Strangs aus. Dies wird während der Rekombination in Kapitel 8 angetroffen. Vielmehr sind die beiden Stränge um dieselbe Helixachse gewickelt und mit sich selbst verflochten, was als plektonämische Spule bezeichnet wird. Eine Folge dieser Verflechtung ist, dass die beiden Stränge nicht getrennt werden können, ohne dass sich die DNA dreht, eine Umdrehung der DNA für jedes "Aufdrehen" der beiden Stränge.

Bei Duplex-DNA sind die beiden Stränge links in einer plektonämischen Spule umeinander gewickelt, nicht rechts in einem paranämischen Duplex. Die N7- und C6-Gruppen von Purinen und die C4- und C5-Gruppen von Pyrimidinen sind in die Hauptrille gerichtet, so dass sie spezifische Kontakte mit Aminosäuren in DNA-bindenden Proteinen herstellen können. Basenpaare stapeln sich mit einer gewissen Drehung zwischen ihnen.

Es wurden drei verschiedene Formen von Duplexnukleinsäuren beschrieben. Die häufigste Form, die in der meisten DNA bei neutralem pH-Wert und physiologischen Salzkonzentrationen vorhanden ist, ist die B-Form.

Das ist die klassische rechtshändige Doppelhelixstruktur, über die wir gesprochen haben. Dies wird als Nukleinsäure in A-Form bezeichnet. Eine dritte Form der Duplex-DNA hat eine auffallend andere linkshändige helikale Struktur. Diese Z-DNA wird durch Strecken alternierender Purine und Pyrimidine gebildet, z.

Eine kleine Menge der DNA in einer Zelle liegt in der Z-Form vor. Es war verlockend vorzuschlagen, dass diese unterschiedliche Struktur in irgendeiner Weise an der Regulation einer bestimmten Zellfunktion wie Transkription oder Regulation beteiligt ist, aber schlüssige Beweise für oder gegen diesen Vorschlag liegen noch nicht vor. Der Hauptunterschied zwischen Nukleinsäure in A- und B-Form besteht in der Konformation des Desoxyribose-Zuckerrings. Es liegt in der C2'-Endokonformation für die B-Form vor, während es in der C3'-Endokonformation in der A-Form vorliegt.

Die letztere Konformation bringt die 5'- und 3'-Hydroxylgruppen, die beide an die Phosphate verestert sind, die an die nächsten Nukleotide gebunden sind, näher zusammen als in der C2'-Endokonformation Abbildung 2. Syn- und Anti-Konformationen der Base relativ zum Zucker in Nukleotiden. Ein zweiter Hauptunterschied zwischen Nukleinsäure in A- und B-Form ist die Platzierung von Basenpaaren innerhalb des Duplex.

Das Ergebnis ist eine bandartige Helix mit einem offeneren zylindrischen Kern in A-Form. Z-DNA ist eine radikal andere Duplexstruktur, wobei sich die beiden Stränge in linkshändigen Helices und einem ausgeprägten Zick-Zack wickeln, daher das Namensmuster im Phosphodiester-Rückgrat. Der große Unterschied liegt beim G-Nukleotid. Es hat den Zucker in der C3'-Endokonformation wie eine Nukleinsäure der A-Form und im Gegensatz zur DNA der B-Form befindet sich die Guaninbase in der Synkonformation.

Dies platziert das Guanin wieder über dem Zuckerring, im Gegensatz zu der üblichen Antikonformation, die in Nukleinsäuren der A- und B-Form beobachtet wird.

Es ist zu beachten, dass die Base in der Antikonformation sie in die Position bringt, in der sie leicht H-Bindungen mit der komplementären Base auf dem gegenüberliegenden Strang bilden kann. Selbst klassische B-DNA ist in ihrer Struktur nicht völlig einheitlich.

Die Röntgenbeugungsanalyse von Kristallen von Duplex-Oligonukleotiden zeigt, dass eine gegebene Sequenz eine charakteristische Struktur annimmt. Diese Variationen in der B-DNA können sich in der Propellerdrehung zwischen den Basen innerhalb eines Paares unterscheiden, um die Basenstapelung zu optimieren, oder in den drei Möglichkeiten, wie sich zwei aufeinanderfolgende Basenpaare relativ zueinander bewegen können: C-Basenpaar Basen passen in das Doppelhelixmodell, wenn Pyrimidin auf einem Strang ist immer mit Purin auf dem anderen gepaart.

Dimensionen der B-Form die häufigste der DNA 0. Unterschiede zwischen Nukleinsäure in A- und B-Form Der Hauptunterschied zwischen Nukleinsäure in A- und B-Form besteht in der Konformation des Desoxyribose-Zuckerrings. Z-Form-DNA Z-DNA ist eine radikal andere Duplex-Struktur, wobei sich die beiden Stränge in linkshändigen Helices und einem ausgeprägten Zick-Zack wickeln, daher das Namensmuster im Phosphodiester-Rückgrat.

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